详细的微生物分类的准则和方法？显微镜可发挥的作用是？
信息分类：生命科学小百科 作者:YIYI发布
微生物分类的准则和方法？
以下讨论一些微生物分类的准则和方法﹕
形态（结构）特性﹕这是最原始和通用的分类方法，既简单又经济，可利用肉眼和显微镜来观察，一般细菌的孢子和鞭毛很容易用这方法辨识别。不过微生物间其他的结构特性则很相似，很难只用肉眼分辨。
染色﹕利用细胞壁成份的异同，染色的方法（例如革兰氏染色法或酸性染色法）可以用来分辨微生物的特性，医生常用这样的方法来辨识病原菌。不过缺乏细胞壁的细菌和细胞壁不稳定的古细菌则无法用这种方法来鉴定。
生化检验﹕纵使相近的微生物，其酵素的种类和活性可能不同，例如检验微生物利用各种碳水化合物的能力，便能够辨识微生物的类别。其他如大肠菌是缺乏氧化酵素（oxidase），Escherichia、Enterobacter、Citrobacter会将乳醣转变成酸和气体，而Salmonella和Shigella则不会。
血清反应﹕血清反应是身体免疫抗体对具有抗原性微生物进行反应的一个证据，利用血清反应来检验微生物，不但可以可以分辨微生物的种（species），甚至可以检定到菌株（strain）的异同。不过，也有可能某些不同种类的菌种，却含有相同或相似的抗原成份，因此使用此法时需配合其他分类方法，进行验证。
噬菌体感染性﹕噬菌体对微生物的感染性具有高度的专一性，它对细胞膜的成份有特别的选择性，因此像血清反应一样，可以用来检验微生物的种类
胺基酸序列﹕微生物经过长时间的演化后，蛋白质的DNA编码多少经过改变，因此比较两个微生物的蛋白质序列，可以检定DNA序列的异同，也可以判定微生物种类演化的异同，蛋白质序列相似性越高的，其分类种类越相近。
脂肪酸种类﹕微生物会合成不同的脂肪酸，因此分析合成脂肪酸的种类，便可以分辨微生物的种类，不过需要配合其他的分类方法。
菌液流动性﹕利用菌液穿过一个小缺口，并测定微生物间和微生物与培养基间的导电性，可以测得微生物得特性。如果在缺口再加上一个雷射光，
则可以利用电脑顺便测量微生物得大小、形状、密度、和表面。如果加上得是萤光，则可以测量萤光细胞，如Pseudomonas，或标记有萤光染色的细胞。牛乳中的Listeria污染便是可以如此检定。
DNA硷基的组成﹕DNA硷基组成一般都是以鸟嘌呤（guanine；G）和胞嘧啶（cytosine；C）总和的百分比来表示（G＋C），理论上相同种类的微生物的（G＋C）的百分比应该相同，种类相似微生物的（G＋C）的百分比应该相近。
DNA指纹﹕特定的DNA剪切酵素（restriction enzyme）可以将相同的微生物DNA剪切成相同长度的片断，因此两种微生物经过DNA剪切酵素处理后，加以电泳分离，便可以判断剪切过的DNA片断长度是否相同。如果DNA指纹差异越小，表示它们的亲缘越近。
核醣体RNA序列﹕核醣体RNA序列是目前最常用来测定生物的差异性和它们发生起源的差别，核醣体RNA存在所有的细胞里，而且较为稳定，容易取得。可以利用聚合酵素连锁反应（polymerase chain reaction；PCR）和核醣体RNA的引子（primers）增殖核醣体RNA片断，进行序列的分析。序列相近的微生物，则亲缘越近。
DNA聚合酵素连锁反应﹕如果微生物无法利用传统的方法培养增殖（例如化石里的植物细胞），则可以利用聚合酵素连锁反应（PCR）的方法，将微生物的DNA或核醣体RNA增殖，再利用特定DNA剪切酵素或DNA序列的方法，来检定微生物的亲缘关係。
核酸杂交﹕DNA是一个双股的基因分子，经加热后，双股会鬆弛并分开，成为两条单股。如果将这单股的DNA固定在合适的材质上，再用已知的单股DNA探针（probes）和这固定的单股DNA反应，如果DNA探针可以和微生物的单股DNA结合，回复双股分子，则表示DNA探针所代表的微生物与被测试的微生物有相同或相近的亲缘。这个方法又称为瑟慎印迹（Southern blotting）。