种类                         最大放大倍数       检体处理                              应用对象
1、明视野显微镜     1,000~2,000         染或未染色                    观察未染色的细菌、黴菌、酵母菌、藻类及原生动物
2、暗视野显微镜     1,000~2,000        通常未加染色                 观察活菌体特殊部位,如Spirochetes
3、萤光显微镜         1,000~2,000       明亮具萤光反应               由萤光反应而有助于临床诊断技术
4、位相差显微镜     1,000~2,000        不同的暗度               检视较大活菌体之细胞构造,如酵母菌、藻类、原生动物及一些细菌
5、电子显微镜       200,000~40,000 于萤幕上显示检体                 检视很小的菌体,如病毒及菌体之超微小构造。