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显微镜检查（Microscopic Examination），乃运用显微镜以观察物质之精密构造谓之。

包括运用矿物显微镜以观察矿物及微量结晶成分之构造；运用千倍以上显微镜从事微生物学、血清学、病理学、组织学、法医学检查；或运用电子显微镜以观察种种精密事物之研究（可放大至一千万倍）等均属之。

        西元一八三八年，德国植物学家许来登（Mathias Jacob Schleiden）主张：“细

胞为构成植物体之单位，所有组织皆为细胞之组合。”一八五七年，于莱比锡（Leipzig）出版医药植物学（Handbuch der Medicinisch-Pharmazeutische Botanik）主张：“异种生药，必须由其细胞组合之相异而判定之。”并谓：“生药学为所有自然科学之母。”盖同种植物之相同器官，具有相同之组织构造，异种植物则否。是以中国药材之生药学研究，大抵均运用此一比较植物组织学方法，以寻绎出同科同属而不同种之植物间，精密的异同之点，凭此以求证其药材之来源，即原植物。同时则本此以鑑定其伪劣品。盖药材之外部形态，但凭目视、鼻嗅、口尝、手触等所谓五官鑑识法，多有不易彻底确认其异同者；不能不取决于内部构造之研究，而作最后之判定。

        生药组织学研究法，乃就药用部分切取，其细切面及纵切面，以观察其全体组织为主，并运用若干呈色反应，或显微化学方法以证明其组织形态或化学成分。

        粉末生药检查法，于药材之全体组织研究完毕后，就药材研碎之粉末，同样在显微镜下，可就其粉末观察其细胞形状以求证其粉末之特征。对于中国药材传统制剂，如丸散、膏丹等之生药学鑑定以及其品质管制，具有决定性功能